En Ciudad Universitaria también se desarrollan actividades de índole científica, a través del CEFIEC (Centro de Formación e Investigación en Enseñanza de la Ciencia), del Instituto de Cálculo y de los institutos asociados del CONICET: Instituto de Astronomía y Física del Espacio (IAFE), Centro de Investigaciones del Mar y la Atmósfera (CIMA), Centro de Investigaciones de Hidratos de Carbono (CIHIDECAR).